La Fundación tiene como objetivos luchar por la vida y la conservación de la mar, los océanos y el medio ambiente, y el desarrollo de los principios de solidaridad entre los pueblos de la mar, objetivos que quedan recogidos de manera especial en el acto insignia de la institución, la Ceremonia de la Unión de los Océanos, que simboliza la fusión de los mares y de sus pueblos a través de la cultura, y se concretan a través de:

• Ejecución de programas y proyectos a nivel nacional e internacional, inspirados todos ellos en una cultura humanista.
• Conservación del medioambiente y biodiversidad marina, e impulso del conocimientos científico marino.
• Propiciar la solidaridad y el emprendimiento en la Mar.
• Prevención y luche contra la contaminación marina.
• Fomento de la seguridad integral y el salvamento marítimo.
• Fomento de la pesca y acuicultura sostenible.
• Divulgación de la protección medioambiental marina.
• Fomento de buenas prácticas marinas de la UE.
• Formación integral marítima.
• Impulso a la cultura y a la historia relacionada con el Mar.
• Conversar y utilizar de forma sostenible los océanos, los mares y los recursos marinos.
• Impulsar la cultura y el conocimiento entre los niños y jóvenes, en especial en los Mares Interiores.